loading buffer

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loading buffer 的中文名字叫上樣緩衝液,6*的緩衝液中可以顯示兩條帶,前面的紫藍色的條帶是溴酚藍,在0.6%、1%、1.4%和2%瓊脂糖凝膠電泳中,溴酚蘭的遷移率分別與1Kb、0.6Kb、0.2Kb和0.15Kb的雙鏈線性DNA片段大致相同;後面的藍色條帶是二甲苯氰,它在1%和1.4%瓊脂糖中電泳時,其遷移速率分別與2Kb和1.6Kb的雙鏈線性DNA大致相似。而對於PAGE膠他們的遷移速率也分別不同。

基本介紹

  • 中文名:上樣緩衝液
  • 外文名:loading buffer
  • 配製量: 5mL
  • 配製方法:5×SDS-PAGE Loading Buffer
主要用途,製備方法,

主要用途

loading buffer的功能主要有兩個。第一,裡邊的指示劑溴酚藍和二甲苯氰FF起到指示的作用,顯示電泳的進程,以便我們適時終止電泳;第二,裡邊的成分甘油可以加大樣品密度,使樣品密度大於TAE,從而沉降到點樣孔中,防止樣品飄出點樣孔。另外,有的Buffer是加有SDS的,一般都會寫明。SDS主要是促使聚合酶變性,因為沒有除盡的聚合酶會結合在DNA雙鏈上影響它的遷移速率。細胞裂解後的裂解液,加loading 100℃加熱,也是為了中止酶促反應,防止提取的蛋白質降解

製備方法

6×loading buffer 一般配置:
6×Loading buffer:
30mM EDTA
36%(v/v) Glycerol
0.05%(w/v) Xylene Cyanol FF
0.05%(w/v) Bromophenol Blue
主要用於DNA電泳
10×Loading buffer:
30mM EDTA
50%(v/v) Glycerol
0.25%(w/v) Xylene Cyanol FF
0.25%(w/v) Bromophenol Blue
主要用於RNA電泳
10 X loading buffer中僅有色素溴酚藍(Bromophenol Blue)一種染料(濃度0.05%);
6 X loading buffer中含色素溴酚藍(Bromophenol Blue)、二甲苯腈藍FF(Xylene Cyanol FF)兩種染料(濃度都是0.05%)
在瓊脂糖凝膠(0.5% ~ 1.4%)中溴酚藍(Bromophenol Blue)約與300 bp的雙鏈線狀DNA的遷移速度相同,二甲苯腈藍FF則與4 kbp的雙鏈線狀DNA的遷移速度相等。
6Xloading buffer是用來上樣的;10Xloading buffer是stop buffer,是停止酶促反應的,如果一定要用10Xloading buffer的上樣當然也可以,唯一要注意的是:10Xloading buffer中多了一樣SDS,它會使酶類如taq酶變性,以PCR產物為例,在電泳泳道上會產生一片彌散,如果電泳跑的距離短,和多出來一條帶沒有什麼區別(大概1000bp左右)。
5×SDS-PAGE Loading Buffer配製方法
組份濃度:
250mM Tris-HCl(pH6.8)
10%(W/V) SDS
0.5%(W/V) BPB
50%(V/V) 甘油
5%(W/V) β-巰基乙醇
配製量: 5mL
配製方法:
1.量取下列試劑,置於10mL塑膠離心管中。
1M Tris-HCl  1.25mL
SDS  0.5g
BPB  25mg
甘油  2.5mL
2.加入去離子水溶解後定容至5mL。
3.小份(500μl/份)分裝後,於室溫保存。
4.使用前將25μl的2-ME加到每小份中。
5.加入2-ME的Loading Buffer可在室溫下保存一個月左右

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