分子進化與系統發育

分子進化與系統發育，本書從研究方法和技術著手，探討了分子進化生物學的熱點問題，系統地介紹了用於蛋白質和DNA進化研究的統計方法。

基本介紹

• 書名：分子進化與系統發育
• 又名：Molecular Evolution and Phylogenetics
• 作者：Masatoshi Nei, Sudhir Kumar
• 譯者：呂寶忠
• ISBN：7040112043
• 出版社：Oxford University Press,高等教育出版社
• 出版時間：2006年9月22日

圖書信息

圖書分類: 教育/科技

地區: 大陸,美國

語言: 簡體中文,英文

簡介:

本書共14章，內容包括：進化的分子基礎、胺基酸序列的進化演變、DNA序列的進化演變、同義與非同義的核苷酸替代、系統發育樹、系統發育的推論、系統發育推斷、系統樹的精確性和統計檢驗、分子鐘與線性樹、祖先核苷酸與胺基酸序列、遺傳多肽性和遺傳、用遺傳標記構建群體樹、學科展望等。..

可供生物學、醫學、農林等相關專業師生使用，也可供有關科研工作者參閱。

目錄

第一章 進化的分子基礎.

1．1 生命的進化樹

1．2 進化機制

1．3 基因的結構與功能

1．4 DNA序列的突變

1．5 密碼子使用頻率

第二章 胺基酸序列的進化演變

2．1 胺基酸差異和不同胺基酸的比例

2．2 泊松校正(PC)和廠距離

2．3 自展法的方差和協方差

2．4 胺基酸的替代矩陣

2．5 突變率和替代率

第三章 DNA序列的進化演變

3．1 兩個序列間的核苷酸差異

3．2 核苷酸替代數的估計

3．3 廠距離

3．4 進化距離的數值估計

3．5 核苷酸序列的對位排列

3．6 進化距離估計中有關序列間隔的處理

第四章 同義與非同義的核苷酸替代

.4．1 進化通徑方法

4．2 基於Kimura雙參數模型的方法

4．3 密碼子3個不同位置的核苷酸替代

4．4 用於密碼子替代模型的似然法

第五章 系統發育樹

5．1 系統發育樹的種類

5．2 拓撲差異

5．3 構樹方法

第六章 系統發育推斷：距離法

6．1 UPGMA

6．2 最小二乘(LS)法

6．3 最小進化(ME)法

6．4 鄰接(NJ)法

6．5 用於系統發育重建的距離測度

第七章 系統發育推斷：最大簡約法

7．1 尋找最大簡約(MP)系統樹

7．2 MP樹的搜尋策略

7．3 一致樹

7．4 分支長度的估計

7．5 力口權簡約法

7．6 用於蛋白質數據的MP法

7．7 共享的遺傳特徵

第八章 系統發育推斷：最大似然法..

8．1 ML法的計算過程

8．2 核苷酸替代模型

8．3 蛋白質似然法

0．4 ML方法的理論基礎

8．5 給定拓撲結構的參數估計

第九章 系統樹的精確性和統計檢驗

9．1 最優原理和拓撲結構誤差

9．2 內部分支檢驗

9．3 自展檢驗

9．4 拓撲結構差異的檢驗

9．5 不同樹樹方法的優缺點

第十章 分子鐘與線性樹

10．1 分子鐘假說

10．2 相對速率檢驗

10．3 系統發育檢驗

10．4 線性構

第十一章 祖先核苷酸與胺基酸序列

11．1 祖先序列推斷：簡約法

11．2 祖先序列推斷：貝葉斯方法

11．3 祖先分支中的同義與非同義替代

11．4 趨伺進化和平行進化

第十二章 遺傳多態性和進化

12．1 遺傳多態性的進化意義

12．2 等位基因頻率數據的分析

12．3 再分群體中的遺傳變異

12．4 多個基因座位的遺傳變異

12．5 DNA多態性

12．6 檢測自然選擇的統計檢驗

第十三章 用遺傳標記構建群體樹

13．1 等位基因頻率數據的遺傳距離

13．2 限制性酶的DNA序列分析

13．3 RAPD數據分析

第十四章 展望

14．1 統計方法

14．2 基因組計畫

14．3 分子生物學與進化

參考文獻

附錄...